Un Modulo Lunare viene misteriosamente distrutto durante il suo rientro sulla Terra, ed un secondo coraggioso tentativo del colonnello Foster quasi gli costa la vita. Straker ritiene che tutto ciò possa essere causato da una sonda aliena nascosta fra i detriti spaziali ed invia un Intercettore per indigare. Mentre la Terra rimane indifesa, un UFO viene avvistato, il suo obbiettivo è il Quartier Generale della SHADO.