Dieci anni dopo la prima conferma di un incidente da parte di un UFO, SHADO è ormai diventata una realtà. Un UFO attacca un aereo incaricato di consegnare delle attrezzature vitali per l'organizzazione, ma all'ultimo minuto viene abbattuto da Sky One. Un essere alieno emerge dai rottami fumanti del velivolo e portato d'urgenza al Quartier Generale della SHADO, ma quali segreti ci rivelera?