La paura si stende su Chicago, quando John ed Abby curano due bambini con sintomi infausti: il fatto costringe il pronto soccorso alla quarantena, fino a quando non arriveranno gli esperti federali.
Mentre John lotta per salvare i giovani, lo staff è intrappolato con pazienti sofferenti e con un carico di anziani ed eccentrici cittadini. I media accorrono all'ospedale, e la polizia controlla le uscite mentre le vittime all'interno iniziano una piccola rissa nel tentativo di scappare dalle pericolose e soffocanti condizioni del reparto.
Jing-Mei e Gregory, che possono aver contratto la malattia, mettono da parte i loro sintomi e collaborano per salvare la vita del solito barbone Stan.