Audrey è entusiasta tanto quanto Joey quando quest'ultima viene scelta per lavorare con il Professor Wilder ad uno speciale progetto. Nel frattempo, Dawson è pronto per iniziare la sua terapia, nella speranza di capire se è meglio per lui tornare all'U.S.C. ed onorare così il padre, o seguire il suo cuore e restare a Boston. La relazione tra Pacey e Karen, invece, continua a svilupparsi, nonostante le preoccupazioni crescenti del ragazzo dovute ai sensi di colpa che sta cominciando a nutrire nei confronti del suo capo.