Tony scopre una discrepanza nella lista passeggeri del volo caduto poche ore prima: qualcuno ha cancellato la prenotazione dell'assassino. Janet riesce a estrapolare un indirizzo dalla carta criptata di Walsh prima che giunga dalla sede centrale George Mason, chiamato da Tony Almeida affinchè controlli la situazione al CTU e soprattutto Jack bauer che, secondo Tony, non si sta comportando secondo regolamento. Mason chiude il CTU: nessuno può entrare nè uscire, ma Jack riesce a scappare e raggiunge l'indirizzo datogli da Jamey. Entra in un magazzino e si imbatte in un uomo che non esita a sparagli. Una poliziotta corre in aiuto di Jack ma, prima che Jack riesca a bloccare l'uomo, questa viene uccisa. La polizia, sopraggiunta sul luogo, arresta l'uomo che, prima di esser portato via, fa capire a Jack che lui sa cosa sta succedendo a sua figlia e che, se la vuole rivedere viva, lo deve liberare. Nel frattempo Rick e Dan incontrano Gaines, consegnano all'uomo Kim e gli assicurano che l'altra ragazza è stata da loro già uccisa. David Palmer rivela alla moglie Sherry che il giornalista che lo sta perseguitando accusa Keith della morte dello stupratore di Nicole e che l'origine delle informazioni sull'accaduto provengono da George ferragamo, ex terapista di Keith.