J.D., Elliot e Turk si lamentano continuamente in quanto non gli sono mai affidati compiti importanti, ma all'improvviso il loro desiderio si realizza: si trovano per la prima volta da soli a gestire l'ospedale senza la supervisione di nessuno. Fortunatamente c'è Carla ad aiutarli e a rasserenarli nelle loro insicurezze. Nel frattempo, il Dr. Cox pur di dimostrare a Jordan di essere cambiato (convincendola così a tornare insieme) accetta di fare un discorso d'elogio al Dr. Kelso nel corso di una premiazione... inutile dire che manderà tutto a rotoli.