Michelle è combattuta a causa di obbligazioni personali e professionali quando deve prendere il comando del CTU dopo che Tony è stato ferito. Kyle e Linda sono catturati dagli uomini di Hector. Jack e Palmer hanno una conversazione segreta, che porta Jack a prendere una decisione drastica di fronte alla minaccia di Salazar. Ma i piani di Jack si complicano quando arriva Chase. Anne spinge Palmer nuovamente sul piano morale di fronte allo schema del ricatto organizzato dal suo ex-marito.