Il team si trova in una strana situazione Teddy Cota scompare dopo aver lasciato la fidanzata incinta, dicendogli di temere che gli extraterrestri torneranno per rapire lui e il loro bambino. Dopo che un amico di Teddy, del 'gruppo di supporto per rapiti dagli alieni', informa il team del recente tentativo di rapimento di Teddy da parte degli 'Uomini in Nero' ("Men in Black"), il solo razionale indizio che il team sembra avere viene da un vicino di casa che ha visto Teddy lasciare entrare nel suo appartamento un uomo molto agitato.
Intanto, mentre Jack cerca di abituarsi all'idea che ora è Vivian a guidare il team, il suo avvocato lo informa che la moglie intende usare la sua precedente relazione con Samantha per ottenere la custodia delle figlie.